Camino a Kioto, Kenshin conoce a Misao Makimachi, una chica joven que resulta ser una kunoichi del Oniwaban-shu y que está buscando a Aoshi Shinomori. Juntos llegan a un pueblo controlado por Senkaku, uno de los hombres de Shishio, que maltrata a la población y asesina a cualquiera que se le enfrente. Solo Kenshin puede salvar este pueblo...
 
Mientras tanto, Sanosuke, que quiere hacerse más fuerte, conoce en el bosque a un misterioso monje que podría enseñarle una técnica especial, pero solo si arriesga su propia vida...